利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育

编号 zgly0000512468

文献类型 期刊论文

文献题名 利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育

作者 张志翔  林善枝  薛娴 

作者单位 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室  河南科技大学农学院 

母体文献 北京林业大学学报 

年卷期 2007,29(5)

页码 1-6

年份 2007 

分类号 Q949.718.15 

关键词 谷精草属  ITS序列  系统发育树  系统发育关系 

文摘内容 以谷精草属(Eriocaulon)的尼泊尔谷精草(Eriocaulon nepalense)、白药谷精草(E.cinereum)、高山谷精草(E.alperstre)、华南谷精草(E.sexangulare)、南亚谷精草(E.oryzetorum)等5个种为研究对象,通过PCR扩增技术获得了谷精草属5个种的内转录间隔区序列,并对ITS序列进行分析.结果发现,供试谷精草属植物的ITS区长度并不完全一致,其ITS1的长度范围为171～306 bp,G＋C含量为38.24%～55.04%;ITS2的长度范围为184～288 bp,G＋C含量为36.46%～57.02%.在此基础上,采用Clustal W version 1.7对所得的ITS序列进行排序与分析,以灯心草属(Juncus)的一个种J.dregeanus为外类群,并使用PAUP 4.0 10 b软件采用最大简约法分析获得最简约的系统发育树。结果表明,在检测的ITS序列的738个位点中稳定位点174个、变异位点564个(包括276个信息位点)。另外,从发育树上平行分出两个大的总分支,其中E.nepalense、E.oryzetorum、E.alpestre和E.cinereum(云南宣威)为一支;E.sexangulare为一支。上述二个分支与外类群聚在一起,bootstrap值为100%。