齿肋赤藓乙醛脱氢酶基因ALDH21的克隆与表达分析

编号 zgly0000652650

文献类型 期刊论文

文献题名 齿肋赤藓乙醛脱氢酶基因ALDH21的克隆与表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 杨红兰  张道远  刘燕  马瑞  张元明 

作者单位 中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室  中南林业科技大学生命科学学院 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2010,29(1)

页码 24-30

年份 2010 

分类号 Q785 

关键词 齿肋赤藓  cDNA克隆  ALDH21  RT-PCR  表达分析 

文摘内容 本文采用RT-PCR方法,从齿肋赤藓(Syntrichia caninervis)总RNA中获得ALDH21基因cDNA序列,连接到pMD19-T载体上并转化E.coli DH5α,阳性克隆经PCR鉴定后测序,将测序结果与GenBank中山墙藓(Tortula ruralis)和小立碗藓(Physcomitrella patens)相关基因序列进行同源性比对。结果表明,实验成功克隆了S.caninervis的ALDH21基因的cDNA序列(GenBank登录号: GQ245973),为一个完整的ORF,其长度为1452bp。该序列与T.ruralis和P.patens的cDNA序列同源性分别为98%和78%,推导的氨基酸同源性分别为97%和87%。生物信息学分析表明该蛋白质分子量为52.98kD,等电点pI为5.96,编码483个氨基酸,具备ALDH21蛋白家族特征;半定量RT-PCR结果表明: ALDH21在干旱胁迫状态时的表达量显著高于水合状态,说明ALDH21基因可能参与干旱胁迫应答。本文为进一步研究齿肋赤藓ALDH21基因的抗旱机理提供理论依据。