胡萝卜AP2/ERF-B1亚族两个转录因子基因的克隆及其非生物胁迫响应分析

编号 zgly0001479588

文献类型 期刊论文

文献题名 胡萝卜AP2/ERF-B1亚族两个转录因子基因的克隆及其非生物胁迫响应分析

作者 黄蔚  王枫  谭国飞  徐志胜  李梦瑶  熊爱生 

作者单位 作物遗传与种质创新国家重点实验室  农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室  南京农业大学园艺学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2014年08期

年份 2014 

分类号 S631.2 

关键词 AP2/ERF  胡萝卜  转录因子  ERF亚族  表达调控 

文摘内容 AP2/ERF是植物中普遍存在的一类重要转录因子,参与植物整个生命周期的生长发育和逆境信号转导。本研究以胡萝卜(Daucus carota)‘黑田五寸’为试验材料,基于其转录组和基因组数据,检索和拼接获得胡萝卜AP2/ERF家族2个转录因子基因序列g39811和g47170。采用RT-PCR方法,分别从‘黑田五寸’中克隆DcERF-B1-1(g39811)和DcERF-B1-2(g47170)转录因子基因。序列分析显示,胡萝卜DcERF-B1-1和DcERF-B1-2转录因子基因分别含有630个和594个开放阅读框,分别编码209和197个氨基酸;均含有相对保守的AP2结合域,具有典型的植物AP2/ERF类转录因子特征。从氨基酸组成成分、理化性质、亲水性/疏水性和三级结构上分析显示,胡萝卜DcERF-B1-1和DcERF-B1-2转录因子亲水性大于疏水性,其氨基酸序列可能属于亲水性蛋白。空间结构分析显示,它们都具有1个α螺旋和3个β折叠。进化树分析显示,二者均属于AP2/ERF家族转录因子中ERF亚族的B1组。实时定量荧光PCR显示,在低温、干旱、盐胁迫的条件下,DcERF-B1-2转录因子比DcERF-B1-1转录因子对逆境的响应更大;在高温的条件下,DcERF-B1-1转录因子比DcERF-B1-2转录因子对逆境的响应更大。