拟南芥叶绿体SSR引物在甘蓝上的应用

编号 zgly0001398050

文献类型 期刊论文

文献题名 拟南芥叶绿体SSR引物在甘蓝上的应用

作者 张扬勇  方智远  王庆彪  刘玉梅  杨丽梅  庄木  孙培田 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011年03期

年份 2011 

分类号 S635 

关键词 甘蓝  叶绿体SSR  波里马油菜  多态性 

文摘内容 根据拟南芥的叶绿体全基因组序列,搜索获得89个叶绿体基因组SSRs(cpSSRs),平均每1.736kb出现1个SSR。针对这些SSR设计cpSSR引物58对,其中32对能在甘蓝上应用。5对引物在甘蓝C300、C322和波里马油菜N478、N479间有多态性,这些片段均位于基因内含子区或基因间隔区。测序结果显示单核苷酸A/T重复数从8个到13个不等。同源性比较表明C300、N479之间的同源性大于两者与拟南芥之间的同源性。