木论喀斯特常绿落叶阔叶混交林土壤细菌多样性及其最优采样数

编号 zgly0001671249

文献类型 期刊论文

文献题名 木论喀斯特常绿落叶阔叶混交林土壤细菌多样性及其最优采样数

作者 陈莉  宋同清  王华  曾馥平  彭晚霞  杜虎  苏樑 

作者单位 中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态过程重点实验室  湖南农业大学生物科学技术学院  中国科学院环江喀斯特生态系统观测研究站 

母体文献 生态学报 

年卷期 2019年09期

年份 2019 

分类号 S714.3 

关键词 喀斯特  细菌多样性  土壤微生物  森林  高通量测序 

文摘内容 土壤微生物在森林生态系统中起着重要作用。为了了解木论喀斯特常绿落叶阔叶混交林土壤细菌的多样性,明确采样数对多样性的影响,采用Illumina Hiseq高通量测序技术对木论喀斯特常绿落叶阔叶混交林土壤细菌多样性进行了初步研究,发现:在82个采样点内,随着采样点增加,不同分类水平的土壤细菌类群数量有增多趋势;当采样点达到82个时,检测出的土壤细菌类群达44门99纲180目356科630属和269822个OTU;82个土壤样品中所检测出的细菌类群平均有28.8门60.9纲108.1目206.8科239.6属和3290.5个OTU,其中门、纲、目分类水平上优势类群所占比例分别为变形菌门(Proteobacteria)(34.51%)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)(18.43%)、根瘤菌目(Rhizobiales)(12.50%)。取样数量对检测出的土壤细菌类群数量有显著影响:在门、纲、目、科的分类水平上,36个、57个、72个、78个样品基本上可代表82个样品监测出来不同分类水平的细菌多样性信息;在属和OTU的分类水平上,当样品数量达到82个时检测出来的相应细菌类群数仍在不断地增加。这些初步的研究结果显示木论常绿落叶阔叶混交林土壤在一定程度上有着较高的细菌多样性水平,该研究为细菌多样性与植物多样性的进一步研究奠定了基础。