PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究

编号 zgly0000479575

文献类型 期刊论文

文献题名 PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究

作者 赵兴青  杨柳燕  陈灿  肖琳  蒋丽娟  马喆  朱昊巍  于振洋  尹大强 

作者单位 污染控制与资源化研究国家重点实验室 

母体文献 生态学报 

年卷期 2006,26(11)

页码 3610-3616

年份 2006 

分类号 Q938 

关键词 沉积物  微生物多样性  变性梯度凝胶电泳(DGGE)  16S  rDNA  序列测定 

文摘内容 采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构, 研究结果表明, 三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp, 为16S rDNA V3～V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20种优势菌群, 且同一湖泊不同采样点DGGE图谱的差异性不大, 细菌群落结构具有较高的相似性, 而太湖样品DGGE条带的数目和位置表现出明显差异, 且不同采样点图谱的差异性较大。三湖泊除具有特征性的微生物种属外, 还分布约5个相同的细菌种群, 可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关。对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序, 结果显示其优势菌群具有不同的序列组成, 其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99%, 2个序列的同源性为96%和93%, 其中2个相似的细菌类群目前尚未获得纯培养。