基于原噬菌体类型的我国柑橘黄龙病菌种群遗传结构分析

编号 zgly0001674419

文献类型 期刊论文

文献题名 基于原噬菌体类型的我国柑橘黄龙病菌种群遗传结构分析

作者 李嘉慧  郑正  邓晓玲 

作者单位 华南农业大学农学院柑橘黄龙病研究室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2019年03期

年份 2019 

分类号 S436.66 

关键词 柑橘黄龙病  原噬菌体  种群遗传结构 

文摘内容 柑橘黄龙病是柑橘生产上最严重的病害之一,由难培养的候选韧皮部杆菌亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus,CLas)引起。目前,已报道的与CLas相关的原噬菌体有3种,并且不同的CLas样品中可以检测到不同类型的原噬菌体或不同类型的组合。本研究基于原噬菌体类型特异引物对从我国南方8省收集的548个黄龙病样品进行原噬菌体类型的鉴定和分析。结果表明,基于原噬菌体类型,在548个样品中共鉴定了7种类型的菌株,分别为Type 1(7.12%)、Type 2(60.22%)、Type 3(3.83%)、Type 1+Type 2(3.28%)、Type 1+Type 3(17.34%)、Type 1+Type 2+Type 3(3.47%)和None类型(不含上述3种类型原噬菌体)(4.74%),其中只携带Type 2类型原噬菌体菌株为华南地区优势种群。此外,基于遗传多样性和遗传距离对我国南方地区的CLas种群进行种群结构分析发现,我国南方地区的CLas种群可以分为3个组,即Ⅰ组(广东、江西、广西、福建)、Ⅱ组(浙江和湖南)以及Ⅲ组(云南和海南),其中Ⅰ组和Ⅱ组又可聚为一大组。该结果可为研究我国柑橘黄龙病流行规律提供一定的理论基础。