基于ITS和trnL-F序列碱基差异的繁缕及其近缘种的亲缘关系分析

编号 zgly0001579585

文献类型 期刊论文

文献题名 基于ITS和trnL-F序列碱基差异的繁缕及其近缘种的亲缘关系分析

作者 赵海光  周建建  曹珊珊  郑玉红  单宇  夏冰 

作者单位 江苏省·中国科学院植物研究所(南京中山植物园)  南京林业大学 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2009年01期

年份 2009 

分类号 Q943 

关键词 繁缕  近缘种  ITS  trnL-F  种间关系 

文摘内容 应用PCR产物直接测序法分析了繁缕〔Stellaria media(L.)Villars〕及其近缘种和鹅肠菜〔Myosoton aquaticum(L.)Moench〕的ITS和trnL-F序列的碱基差异,并以孩儿参〔Pseudostellaria heterophylla(Miq.)Pax〕为外类群构建N-J系统树,分析了这些种类的种间亲缘关系。结果表明,供试的繁缕属(Stellaria L.)种类及鹅肠菜的ITS和trnL-F序列长度分别为521~784和788~951 bp,各有变异位点77和59个,其中信息位点分别为18和11个,种间碱基差异百分率分别为6.5%和3.1%。ITS的碱基组成为A22.1%、T20.9%、G28.5%和C28.5%,G+C含量57.0%;trnL-F的碱基组成为A 35.9%、T33.7%、G 15.7%和C 14.8%,G+C含量30.5%。繁缕、雀舌草(S.alsine Grimm)和箐姑草(S.vestita Kurz)的ITS和trnL-F序列一致;鹅肠菜的ITS序列中有4个位点与前述种类不同,但trnL-F序列则相同;中国繁缕(S.chinensis Regel)的ITS和trnL-F序列与孩儿参较相似。在N-J系统树中,鹅肠菜与繁缕、雀舌草和箐姑草聚为一支,表明它们的亲缘关系相对较近,支持将鹅肠菜重新归入繁缕属的分类处理。研究结果显示,ITS和trnL-F序列分析均可用于繁缕及其近缘种的鉴别,且ITS是更为适宜的分子标记。