油茶种子数量相关基因EPFL2的鉴别

编号 zgly0001739722

文献类型 期刊论文

文献题名 油茶种子数量相关基因EPFL2的鉴别

作者 赵松子  左继林  幸伟年 

作者单位 江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室 

母体文献 南方林业科学 

年卷期 2021,49(6)

页码 1-3

年份 2021 

分类号 S794.4  Q786 

关键词 普通油茶  EPFL2  种子数量  胚珠  同源基因 

文摘内容 拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtEPFL2基因属于EPF/EPFL基因家族中的EPFL1/2/3亚家族,与种子数量有关。对普通油茶(Camellia oleifera)幼叶、未成熟种仁、花蕾、根的转录组数据进行挖掘,得到3条油茶EPFL2基因序列;从油茶基因组3代测序数据中鉴别出含有前述3条序列的基因组DNA序列;最后,得到3条油茶EPFL2基因全长CDS序列,分别命名为CoEPFL2a、CoEPFL2b、CoEPFL2c。用MEGA7构建EPFL1/2/3亚家族蛋白质系统进化树,结果表明:CoEPFL2a、CoEPFL2b、CoEPFL2c属于EPFL2分支,并且CoEPFL2a、CoEPFL2c与AtEPFL2在同一个亚分支。用SignalP-5.0预测蛋白信号肽与酶切位点,结果表明:AtEPFL2、CoEPFL2c含信号肽与酶切位点,CoEPFL2a、CoEPFL2b不含;CoEPFL2c可能与AtEPFL2具有同样的功能,即通过调节胚珠密度影响种子数量。