应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因

编号 zgly0000797074

文献类型 期刊论文

文献题名 应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因

学科分类 220.3010;森林病理学

作者 杨明  王日葵  周炼  葛文东  焦雁翔 

作者单位 西南大学园艺园林学院  中国农业科学院柑桔研究所 

母体文献 中国农业科学 

年卷期 2012,45(5)

页码 917-925

年份 2012 

分类号 S666.309.3 

关键词 椪柑  抑制性差减杂交  枯水  表达序列标签  差减文库  聚类分析 

文摘内容 【目的】探索椪柑枯水分子机理,寻找柑橘枯水应答基因,为柑橘枯水防治奠定基础。【方法】利用抑制性差减杂交技术以椪柑正�鈉DNA作为Driver,以枯水果肉cDNA作为Tester构建正向差减文库。【结果】挑选了300个有效克隆进行测序分析,260个测序成功。经BLASTx比对分析,197条表达序列标签(ESTs)找到了分属于52个基因的同源序列;63条ESTs同源性较低或没有同源性。对文库中编码β-微管蛋白、衰老相关蛋白、细胞色素c、半胱氨酸蛋白酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、转运蛋白、天冬氨酸蛋白酶前体、WRKY转录因子21的基因进行实时定量RT-PCR验证,结果显示这8个基因均明显上调表达。这些差异性表达基因主要涉及衰老、抗逆防御、几丁质和细胞壁代谢、蛋白降解等过程。【结论】通过构建椪柑果肉枯水正向文库,得到一些与枯水相关的基因,这些基因反映了果实对枯水的调控情况,可作为今后防治枯水病害的候选基因。