裸燕麦Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的分离、鉴定与分析

编号 zgly0001648673

文献类型 期刊论文

文献题名 裸燕麦Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的分离、鉴定与分析

作者 郭晓芳  贾举庆  张晓军  张春来  张美俊  冯美臣  杨武德 

作者单位 山西农业大学农学院  山西省农业科学院作物科学研究所 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 S512.6  Q943.2 

关键词 裸燕麦  Ty1-copia类反转录转座子  进化  转录活性 

文摘内容 本研究根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从裸燕麦(Avena nuda L.)品种‘品燕1号’基因组中分离获得23条Ty1-copia类反转录转座子序列,并对序列特征、系统发育关系及其转录活性进行分析。结果显示,23条Ty1-copia类反转录转座子存在较高的异质性,序列间的一致性为45%～98%,存在插入、移码和终止密码突变,但频率不高;系统发育分析结果表明,燕麦Ty1-copia类反转录转座子在进化过程中主要为垂直传递。本研究通过检索燕麦基因表达数据库,发现了5个有转录活性的Ty1-copia类反转录转座子。