莲品种DNA指纹图谱的构建

编号 zgly0001630302

文献类型 期刊论文

文献题名 莲品种DNA指纹图谱的构建

作者 薛建华  姜莉  马晓林  邴艳红  赵思晨  马克平 

作者单位 中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室  北京市海淀区圆明园管理处 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2016年01期

年份 2016 

分类号 Q943 

关键词 DNA指纹  微卫星  Nelumbo  品种鉴定  分子身份证 

文摘内容 为了克服单纯依据形态特性鉴定品种的局限性,我们开展了莲品种DNA指纹图谱构建研究,旨在对其品种的快速准确鉴定及专利权保护等起一定作用。本研究以圆明园保存的72个莲品种为实验材料,用来自不同地点的1,409份野生莲(Nelumbo nucifera)和58份美洲黄莲(N.lutea)群体样本作遗传背景参照。从104对核微卫星引物(n SSR)中筛选出15对,从17对叶绿体微卫星(cp SSR)引物中筛选出2对,共17对引物作为72个莲品种DNA指纹鉴定的条码。15对n SSR引物共检测到94个等位基因(平均6.27个),其中11个属于美洲黄莲,65个属于野生莲,18个不能区分;多态信息含量(PIC)介于0.3899–0.8023之间(平均0.5748)。2对cp SSR引物共检测到13个单倍型,其中9个属于野生莲,4个属于美洲黄莲。全部17对引物标记结果显示,共有19个品种含有美洲黄莲遗传组分,其中8个母系来源于美洲黄莲;有36个品种(涉及12对引物)具有至少1个特有基因型;最少8对引物组合可完全区分开68个品种。有2组共4个品种组内全部17对引物均不能区分。本研究通过核心引物组合法使68个莲品种获得特异性DNA指纹。推荐13对n SSR和2对cp SSR共15对引物作为莲品种鉴定的核心条码,并建议将形态特征与DNA指纹相结合作为莲品种的鉴定标准。