猪源Bb SC-SN株的分离鉴定及其皮肤坏死毒素(DNT)全基因序列分析

编号 zgly0001534716

文献类型 期刊论文

文献题名 猪源Bb SC-SN株的分离鉴定及其皮肤坏死毒素(DNT)全基因序列分析

作者 肖璐  邬旭龙  王印  姚学萍  杨泽晓  胡凌  林星宇  任梅渗  曾相杰  罗忠永 

作者单位 四川农业大学动物医学院  动物疫病与人类健康四川省重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年12期

年份 2016 

分类号 S852.61 

关键词 支气管败血波氏杆菌  分离鉴定  皮肤坏死毒素基因  猪 

文摘内容 【目的】了解当前支气管败血波氏杆菌(Bb)地方菌株皮肤坏死毒素(DNT)基因的变异特点。【方法】利用分离培养、PCR及16SrRNA扩增片段同源性分析,对采自四川遂宁某规模化猪场有明显萎缩性鼻炎症状的鼻拭子进行病原分离鉴定,并对分离株的DNT基因进行克隆和序列分析,对其抗原域、氨基酸二级结构、特定区域位于蛋白质表面可能性等参数进行预测,分析其B细胞抗原表位。【结果】成功分离得到一株支气管败血波氏杆菌,命名为支气管败血波氏杆菌SC-SN株。分离株DNT基因序列全长4 357bp,与其他11株菌DNT基因的核苷酸序列同源性为93.1%~100.0%,但由于其356位插入碱基A,使得该序列仅编码1 426个氨基酸,与上述11株DNT基因编码的氨基酸序列同源性仅为12.8%~47.0%。遗传进化树显示,SC-SN分离株与S798日本株和未知1株的亲缘关系最近。软件预测结果显示,Bb SC-SN株DNT基因编码氨基酸B细胞抗原表位发生较大变化。【结论】经鉴定,分离株确为支气管败血波氏杆菌,且SC-SN株的DNT基因序列变异较大,第356位插入的碱基A,对其氨基酸序列、ORF及B细胞抗原表位分布产生了较大的影响。