三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析

编号 zgly0001444072

文献类型 期刊论文

文献题名 三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析

作者 王建辉  刘建军  陈克玲  李洪雯  何建  关斌 

作者单位 四川省农业科学院园艺研究所  农业部西南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室  四川省农业科学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S436.631 

关键词 葡萄卷叶伴随2型病毒  葡萄B病毒  葡萄A病毒  病毒外壳蛋白基因  病毒沉默抑制子基因 

文摘内容 【目的】为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,【方法】比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法。分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析。【结果】结果表明,改进硅胶颗粒吸附法快速从葡萄枝条的韧皮组织中提取了总RNA,并以葡萄18SRNA为内参基因,RT-PCR分别成功扩增出3种病毒的目的片段。把16个地理起源的GLRaV-2分离株的外壳蛋白基因(Coat protein,CP)分成5个系统进化组。而7个地理起源的GVB分离株CP同源性为79.1%～98.7%。此外,5个GVA四川分离株分别位于系统进化树的4个聚类群。【结论】GLRaV-2、GVB和GVA不同地理起源的分离株在核酸水平上具有变异性,其中GVA四川分离株之间具有显著的遗传差异,可能包括4种株系。