天山沿线地区(中国)常见种子植物DNA条形码的遴选

编号 zgly0001707089

文献类型 期刊论文

文献题名 天山沿线地区(中国)常见种子植物DNA条形码的遴选

作者 刘彦廷  张明理  张道远 

作者单位 干旱区生物地理与生物资源中国科学院重点实验室(中国科学院新疆生态与地理研究所)  中国科学院大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2020年08期

年份 2020 

分类号 Q948 

关键词 种子植物  DNA条形码  天山 

文摘内容 于2015年7—8月份,对中国天山沿线地区(北纬39°25′12″～45°5′3″、东经75°2′28″～94°27′51″)的荒漠带、山地草原带、山地森林带、亚高山草原带、亚高山草甸带、高山草甸带的优势种和建群种进行了补充采集,每个物种尽可能选择2个或2个以上的个体,共采集113种250份植物样品;应用最大似然树(ML Tree)的方法,对天山沿线地区(中国)的306种植物进行DNA条形码分析,从物种与属水平统计了4个候选DNA条形码(ITS、matK、rbcL、trnH-psbA)在整体与多种属两方面的识别率差异,遴选天山沿线地区常见种子植物的DNA条形码。结果表明:整体上,ITS在单条形码中的识别率最高,为81.70%(种)、97.07%(属);多条形码组合分析中,ITS+matK+trnH-psbA的识别率最高,为86.66%(种)、96.59%(属),其次为ITS+matK(86.27%(种)、96.59%(属))、ITS+rbcL(86.66%(种)、95.12%(属))。对多种属的分析显示,ITS的识别率在单条形码中依然最高(69.28%(种)、98.08%(属));多条形码组合分析中,ITS+matK+trnH-psbA、ITS+matK的识别率最高,均为75.16%(种)、96.15%(属)。综合分析结果,依据通用性、识别性、经济性的原则,推荐ITS+matK为天山沿线地区常见种子植物的DNA条形码。