珙桐DiCCoAOMT1基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001637151

文献类型 期刊论文

文献题名 珙桐DiCCoAOMT1基因的克隆及生物信息学分析

作者 吴小波  李梅  李萌  董旭杰  彭继庆  胥雯  曹福祥 

作者单位 中南林业科技大学生命科学与技术学院 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2018年07期

年份 2018 

分类号 S792.99 

关键词 珙桐  CCoAOMT基因  木质素  种子休眠 

文摘内容 种子休眠期长是导致珙桐自然繁殖力低下的重要原因之一。珙桐内果皮在发育后期快速木质化形成坚硬而致密的结构,可能是决定种子休眠时间的重要因素,而这一过程的调控机制尚不明确。本研究小组前期通过对珙桐内果皮发育的4个时期进行转录组测序,发现CCo AOMT基因家族与内果皮快速木质化关系密切。本研究从转录组中筛选到11个珙桐CCo AOMT基因家族基因,并利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、序列特征、细胞定位和系统进化分析。分析显示,11个珙桐CCo AOMT基因根据表达模式可分为2种类型,筛选其中6个表达差异显著的CCo AOMT基因进一步分析其表达规律,最后确定其中差异表达最显著的Cluster-149.63013序列进行克隆及生物信息学分析。结果表明,该基因开放阅读框全长为744 bp,编码247个氨基酸,其氨基酸序列含有植物甲基化酶所共有的A、B、C基序及CCo AOMT蛋白特有的标志性序列D、E、F、G和H,其氨基酸序列与辣椒的CCo AOMT蛋白同源性最高,将其命名为Di CCo AOMT1。本研究克隆得到的Di CCo AOMT1基因可能是珙桐内果皮木质素快速积累的关键调控基因。