南方根结线虫伴生细菌宏基因组fosmid文库构建及其特征分析

编号 zgly0001360784

文献类型 期刊论文

文献题名 南方根结线虫伴生细菌宏基因组fosmid文库构建及其特征分析

作者 张玉  茆振川  陈国华  冯东昕  谢丙炎 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2009年06期

年份 2009 

分类号 S432.45 

关键词 南方根结线虫  fosmid文库  伴生细菌  互作关系  多样性 

文摘内容 为了研究南方根结线虫与伴生细菌的互作及其伴生细菌多样性,采用碘海醇介质离心技术、SDS裂解法和酚/氯仿抽提法等构建了南方根结线虫Meloidogyne incognita伴生细菌宏基因组fos-mid文库,并进行文库特征分析。结果表明,该文库包含3万个克隆,插入片段大小分布在30~45kb之间,平均长度为40kb左右;共计包含1171Mb DNA;质粒在fosmid传代中稳定遗传,没有发现插入片段的丢失或重排。末端测序结果显示,文库中南方根结线虫序列占2.04%,细菌序列占44.90%,无同源序列占53.06%;南方根结线虫伴生细菌优势种群为Sphingopyxis属和代尔夫特菌属Delftia。