广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究

编号 zgly0001566056

文献类型 期刊论文

文献题名 广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究

作者 苏龙  徐志健  乔卫华  郑晓明  梁云涛  丁膺宾  刘莎  齐兰  公婷婷  梁新霞  王君瑞  张丽芳  程云连  兰进好  杨庆文 

作者单位 青岛农业大学农学院  中国农业科学院作物科学研究所  广西农业科学院水稻研究所 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 S511.9 

关键词 药用野生稻  遗传多样性中心  聚类分析  SSR引物数量 

文摘内容 采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094(RM240)~2.2674(RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240)~0.5591(RM448),平均值为0.2112;Shannon多样性指数I在0.0393~0.9296之间变动,平均值为0.3624。数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3>南宁-1>梧州-2>梧州-1>南宁-2>玉林-2>贵港-2>梧州-4>玉林-3>玉林-1>贺州>贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心。通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果。研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对。