罗汉果全基因组Survey分析

编号 zgly0000932561

文献类型 期刊论文

文献题名 罗汉果全基因组Survey分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 唐其  马小军  莫长明  潘丽梅  韦荣昌  赵欢 

作者单位 湖南农业大学园艺园林学院  广西药用植物园  中国医学科学院药用植物研究所 

母体文献 广西植物 

年卷期 2015(6)

页码 786-791

年份 2015 

关键词 罗汉果  基因组测序  杂合率  GC含量  鸟枪法测序策略 

文摘内容 罗汉果是广西特有药用及甜料植物,其主要成分之一甜苷V作为天然、非糖甜味剂,具有广阔的开发前景,但罗汉果目前完全来自于栽培,适生区狭窄,连作障碍严重,加之含量低导致甜苷V生产成本居高不下,严重限制了其应用。为了减少盲目性,在大规模全基因组深度测序之前,先做低覆盖度的基因组Survey测序,评价基因组的大小及复杂程度,以确定适合该植物全基因组的测序研究策略。该研究采用第二代高通量测序技术(Illumina Hiseq TM 2000)首次测定了罗汉果基因组大小,并利用生物信息学方法估计罗汉果杂合率、重复序列和GC含量等基因组信息。