家蚕蛋白质数据检索系统

编号 zgly0001399778

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕蛋白质数据检索系统

作者 邹勇  罗冰  段军  钟晓武  赵萍  夏庆友 

作者单位 西南大学蚕学与系统生物学研究所家蚕基因组学国家重点实验室  重庆大学农学与生物技术学院 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2011年06期

年份 2011 

分类号 S881.24 

关键词 家蚕  蛋白质组  数据库  检索 

文摘内容 蛋白质组研究对于基因功能的阐释具有极其重要的作用。为了使研究者方便快捷地查询到家蚕蛋白质组数据,以已鉴定的家蚕蛋白质数据为基础,在NetBeans 6.5开发环境中,于Rails 2.2.2编写框架下采用ruby 1.8.6语言,利用MySQL数据库实现对数据储存与调用,构建了家蚕蛋白质数据检索系统(http:∥www.silk2db.org:3000)。该系统不仅收录了已鉴定家蚕蛋白质的基础信息,还收录了试验条件、质谱峰图、肽段检索参数和参考文献等信息。研究者可以根据试验名称、家蚕组织或器官名称、登录号、蛋白质的等电点和分子质量范围等实现对这些蛋白质相关信息的快速查询。该系统数据可为家蚕基因功能研究提供有益信息和重要支撑,并能为家蚕蛋白质组学试验方法的探索与改进提供线索。