我国口岸瓜实蝇监测样本的SSR分子标记分析

编号 zgly0001693112

文献类型 期刊论文

文献题名 我国口岸瓜实蝇监测样本的SSR分子标记分析

作者 许佳丹  王书平  蒋费涛  朱雅君  叶军  李飞 

作者单位 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心  浙江大学昆虫科学研究所  重庆三峡学院环境与化学工程学院 

母体文献 生物安全学报 

年卷期 2019年04期

年份 2019 

分类号 S41-30 

关键词 瓜实蝇  转录组  微卫星标记  遗传多样性 

文摘内容 【目的】瓜实蝇是世界性检疫害虫,被列入我国口岸常年监测计划中。本研究以检疫性有害生物瓜实蝇为研究对象,利用不同地理种群瓜实蝇的转录组发现特异性的微卫星(simple sequence repeats, SSR)序列,分析我国口岸监测的瓜实蝇样本的遗传多样性。【方法】利用生物信息学方法,对4个不同地理来源的瓜实蝇转录组进行分析,发现了特异性的SSR序列,并设计特异性引物,选用我国11个省市的49个瓜实蝇监测样本进行测试及验证,使用NTsys和Popgene 32软件进行遗传多样性分析。【结果】筛选出15对多态性较好的引物,UPGMA聚类分析显示,新疆、四川和广西种群归为一支,浙江、广东、江苏种群归为一支,上海、云南、海南、天津种群归为一支,北京种群单独聚为一支。【结论】聚类分析结果显示,11个不同省市的瓜实蝇监测样本间基因分化系数为0.6712,表明不同口岸的瓜实蝇监测样本间的遗传分化较大,可能具有不同的来源地,可为进一步开发监测样本溯源技术提供理论依据。