多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL作图的通用方法

编号 zgly0000577297

文献类型 期刊论文

文献题名 多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL作图的通用方法

作者 敖雁  胡治球  汤在祥  王学枫  徐辰武 

作者单位 扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室 

母体文献 中国水稻科学 

年卷期 2008,22(4)

页码 427-431

年份 2008 

分类号 Q94-332  Q943 

关键词 相关群体  数量性状座位  基因定位  极大似然估计方法 

文摘内容 对多亲本杂交衍生的多个群体的联合分析将有助于QTL的定位和基于QTL分析的育种实践，但目前还没有一个可对这类群体进行联合分析的通用方法。在以往发展的双亲杂交衍生的多个相关群体QTL图谱的联合构建方法的基础上，进一步拓展为可以对多个亲本杂交衍生的多个相关群体进行联合分析。首先建立了多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL联合作图的通用遗传模型，然后根据混合分布理论建立基于EM(expectation maximization)算法实现的QTL作图的极大似然估计方法。以循环杂交设计的3个F2群体为例用计算机模拟数据研究了QTL遗传力和样本容量2个因素对方法的影响。结果表明，无论是统计功效，还是参数估计的准确度和精确度，相同遗传力下，对循环杂交设计的3个F2群体联合作图均优于对其中的任2个F2群体联合作图。该方法的主要优点：一是可以比较和综合已有的对单个作图群体的定位结果，提高QTL检测的功效和定位的精度；二是在多亲本涉及的等位基因数更多的情形下，可以扩大和发掘有关数量性状的基因资源，从而为育种学家改良相应的数量性状奠定重要基础。