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葱兰夜蛾幼虫肠道细菌群落结构与多样性分析



编号 zgly0001671871

文献类型 期刊论文

文献题名 葱兰夜蛾幼虫肠道细菌群落结构与多样性分析

作者 蔡泱莲  黄宽官  黄俊浩  吴鸿 

作者单位 浙江农林大学林业与生物技术学院 

母体文献 浙江林业科技 

年卷期 2019年02期

年份 2019 

分类号 S436.8 

关键词 葱兰夜蛾  幼虫  肠道细菌  多样性  16SrDNA  高通量 

文摘内容 为明确葱兰夜蛾Brithys crini(Fabricius,1775)幼虫肠道细菌的群落结构和多样性,利用IonS5TMXL高通量测序平台对肠道细菌16S rDNA基因V3-V4变异区进行测序,应用Cutadapt、Uparse等软件整理、统计样品序列数和OUT数,分析肠道细菌的物种组成、丰度和多样性。4个虫体肠道样本测序拼接后,共得273 453条序列和在97%相似度下平均每个样本可聚类为512个OTU数目,总共注释到23门57纲86目168科347属,优势菌群为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicute。葱兰夜蛾肠道细菌Simpson指数、Shannon指数和Chao1指数分别为0.93~0.98,5.67~6.82和439.57~584.12。结果表明葱兰夜蛾幼虫肠道细菌多样性比较丰富,个体间微生物群落结构和多样性有差异。

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