长雄野生稻(Oryza longistaminata)全基因组Fosmid文库构建

编号 zgly0001433937

文献类型 期刊论文

文献题名 长雄野生稻(Oryza longistaminata)全基因组Fosmid文库构建

作者 李丽娟  蔡晶  张石来  王荔  胡凤益 

作者单位 云南农业大学  云南省农业科学院粮食作物研究所  中国科学院昆明动物研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 S511.9 

关键词 长雄野生稻  Fosmid文库  末端测序 

文摘内容 长雄野生稻(O.longistaminata)起源于非洲,具有和亚洲栽培稻相同的AA基因组,是栽培稻改良的重要遗传资源。本研究构建了长雄野生稻全基因组fosmid文库,共获得33.6万克隆,文库的平均插入片段大小约为40kb,其中94.7%的克隆插入片段大小在30~50kb之间。挑取其中约11万克隆并保存,可覆盖10倍栽培稻基因组,对任意基因或序列的筛选概率达到了99.99%。将剩余的22万个克隆进行了末端配对测序,显示其有助于长雄野生稻全基因组测序的拼接。所构建的fosmid文库为筛选和克隆长雄野生稻的有利基因提供了研究材料。