家蚕scaffold中新微卫星标记的获得与Dll基因的遗传连锁分析

编号 zgly0001329203

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕scaffold中新微卫星标记的获得与Dll基因的遗传连锁分析

作者 郭秋红  詹帅  相辉  赵云坡  李卫华  黄勇平 

作者单位 中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所  江苏科技大学生物与环境工程学院  中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所 上海200032  上海200032  镇江212018 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2007年02期

年份 2007 

分类号 S881.26  Q78 

关键词 家蚕  微卫星标记  Scaffold  Dll基因  连锁分析 

文摘内容 在进行家蚕遗传连锁图谱的整合过程中,需要寻找两个作图群体中都有多态的共有标记,但这种共有标记数量较少。为此,利用已有的简单重复序列(SSR)与家蚕基因组进行比对,寻找到匹配的scaffold,再采用SS-RHunter1.3搜索其中的SSR区域,排除掉原有SSR序列,选择重复次数在6～23之间的微卫星区域设计引物,用BC1群体的亲本及F1进行多态性的筛选,选择有多态性的标记用7019×(F50B×7019)BC1群体进行基因型分析。结果显示:根据原家蚕第2连锁群上SSR位点新设计的邻近的7对引物中,有6对引物在BC1群体的亲本中有多态性,选择其中2个进行遗传连锁分析,作图结果与原有相应SSR标记的作图结果基本保持一致,其中根据S0207所在scaffold上开发的NS02071和NS02072之间的图距达到6.9 cM;根据家蚕大造和C108的回交一代初步定位的D ll基因的位置与后来在其所在scaffold上所设计的临近引物D ll1和D ll2的定位一致,且这两个标记在遗传连锁图上的图距为0.0 cM,表明这两个标记在遗传图上的位置重叠。由此,在较短的DNA区域内(在遗传连锁图上表现1个位点)便有多个SSR标记可供使用,将为定位家蚕重要经济性状基因、分子辅助育种及功能基因研究等提供更多有价值的信息。