山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析

编号 zgly0001479261

文献类型 期刊论文

文献题名 山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析

作者 尤欢  周阿涛  岳亮亮  寸东义  丁元明 

作者单位 云南农业大学植物保护学院  云南出入境检验检疫局  昆明理工大学生命科学与技术学院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2014年03期

年份 2014 

分类号 S685.14 

关键词 DMSO  ITS  山茶属  假基因 

文摘内容 以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防止ITS假基因的扩增;(2)与功能拷贝相比,ITS假基因序列的ITS1和ITS2区存在多处碱基缺失,GC含量明显偏低,5.8S区二级结构稳定性降低;(3)应用ITS假基因进行种水平的系统发育分析会对其真实的系统关系造成影响,提示进行系统进化研究时应警惕假基因的干扰。