采用RAPD-PCR技术评估果蝇肠道噬菌体多样性

编号 zgly0001685855

文献类型 期刊论文

文献题名 采用RAPD-PCR技术评估果蝇肠道噬菌体多样性

作者 杜蓓蓓  孙浩  杨伟超  董玉玲  徐慧 

作者单位 中国科学院沈阳应用生态研究所  中国科学院大学 

母体文献 生态学杂志 

年卷期 2019年11期

年份 2019 

分类号 Q93-33 

关键词 肠道病毒  多样性  RAPD  黑腹果蝇 

文摘内容 噬菌体作为微生物群落结构和功能的主要驱动力之一,研究其在动物肠道中的生态进化过程具有重要意义。本研究以黑腹果蝇为模型,探究以随机多态性DNA聚合酶链式反应(RAPD-PCR)病毒指纹技术评估肠道噬菌体的多样性。结果表明,野生型黑腹果蝇肠道噬菌体的多样性高于InR突变体黑腹果蝇。InR突变体果蝇在孵化为成虫后,可能经历一段短期的肠道噬菌体扰动,与第3天相比,第15天的肠道噬菌体多样性显著降低,而健康的野生型果蝇则没有明显变化。进一步利用落射荧光显微镜测量噬菌体和细菌的丰度,在第3天和15天,野生型果蝇游离噬菌体和细菌均处于稳定状态。第3天InR突变体果蝇肠道细菌的丰度显著降低,病毒与细菌丰度的比值(VBR)明显高于其他组;第15天InR突变型果蝇噬菌体的多样性降低,VBR明显低于各处理组。本文证实了InR突变体果蝇肠道噬菌体生态学特征与野生型存在一定的差异,也表明RAPD-PCR病毒指纹技术可以实现对肠道病毒多样性的快速评估。