一种通过纤维发育来确定巴苦竹基因表达的基因组的方法

编号 zgly0000806567

文献类型 期刊论文

文献题名 一种通过纤维发育来确定巴苦竹基因表达的基因组的方法

学科分类 220.1520;林木遗传学

母体文献 世界竹藤通讯 

年卷期 2012(3)

页码 47-47

年份 2012 

分类号 S562 

关键词 CLSM  表达序列标签  纤维素  纤维  木质素 

文摘内容 摘要: 竹纤维的发育是一种复杂但有序的现象。在植物学中, 关于竹纤维发育的第一手资料主要是基于简易解剖学和对精密的激光共焦扫描的微观特征的思考。然而, 在分子机制方面对纤维发育的知识并没有被完全探明。在本研究中, 采用基于PCR的消减抑制杂交技术对从巴苦竹叶片组织分离的cDNA和其不同发育阶段的节问组织进行处理以识别巴苦竹纤维发育有关的基因。差异筛选结果显示, 在纤维发育的3个阶段中, 即萌生、伸长和成熟的3个阶段, 总的表达序列标签(ESTs)中有53%的被上调(wereup—regulated)。使用Blast2GO软件将这些表达序列标签中156个已知功能的被组装的表达序列标签进一步分为不同的功能类别后发现, 这些已被分类的表达序列标签中, 有51个显示专有的纤维特性。本文选取了13个在巴苦竹节间发育不同阶段的具有专有纤维特性的cDNAs的分布和差异表达模式进行了研究。本研究结果清楚地表明, 相关基因的纤维在细胞整体化的几个进程中涉及到Ca+信号通路, 细胞壁的合成、激素调节, 细胞膨压的维持, 以及细胞骨架蛋白合成途径。这表明关于纤维发育的复杂特性是受控的新陈代谢过程, 这种受控的新陈代谢过程与涉及到相关基因级联(genecascade)纤维素差异表达有关。一种巴苦竹纤维发育时纤维素和木质素生物合成假设模型已经被提议包含已被识别的基因。不同的可预测的蛋白质之间的分子间的相互作用可通过途径工作室软件(PathwayStudiosoftware)进行推测。各种直接或间接通过几个节点蛋白(nodalprotein)联系起来的细胞通道的网络被蔗糖合成酶所标记, 这些蔗糖合成酶作为一种节点蛋白在启动多种细胞功能, 并在纤维素和木质素的生物合成中起着十分重要的作用。