三峡库区优异稻种资源遗传多样性及群体结构分析

编号 zgly0001690939

文献类型 期刊论文

文献题名 三峡库区优异稻种资源遗传多样性及群体结构分析

作者 唐如玉  邹玉霞  陈娇  雷丽霞  唐江红  甘露  张佳妮  罗兰  沈航  台琳玉  赵正武 

作者单位 重庆师范大学生命科学学院/重庆市特色作物资源工程技术研究中心 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S511 

关键词 水稻  三峡库区  微卫星标记  遗传多样性  群体结构 

文摘内容 为了阐明三峡库区优异稻种资源的遗传多样性和群体结构,本研究利用25对SSR多态性分子标记对三峡库区不同地理来源和不同类型的81份优异稻种资源进行了遗传多样性和群体结构分析。研究结果显示,上述标记能够高效鉴别参试材料的遗传多样性水平。共检测到56个等位基因,每个位点检测到的等位基因数为2～5,平均为2.44;有效等位基因数变异范围为1.077～2.582,平均为1.757;多态性信息量(PIC)为0.069～0.539,平均为0.332;Shannon信息指数为0.158～1.017,平均为0.625;Nei′s基因多样性指数为0.071～0.665,平均为0.407。进一步分析发现,地方品种的平均有效等位基因数高于选育品种,而选育品种的平均等位基因数和Shannon信息指数高于地方品种,两者的基因多样性指数、多态信息含量和期望杂合度极为相近。聚类分析、群体结构分析和主成分分析显示供试材料可分为2个类群,3种分类结果大致相同,各类群聚集的地域性规律不明显,品种的聚类关系较复杂。分子方差分析表明居群间的变异和品种间的变异百分率相当,变异来源于居群间和品种间。