基于RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析

编号 zgly0001579411

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析

作者 汤诗杰  郑玉红  汤庚国 

作者单位 江苏省·中国科学院植物研究所(南京中山植物园)  南京林业大学森林资源与环境学院 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 Q943  S792.36 

关键词 南京椴  RAPD标记  居群变异  遗传多样性  基因分化  聚类分析 

文摘内容 采用RAPD标记技术,对分布于江苏省(紫金山、牛首山和宝华山)及安徽省(皇藏峪和琅琊山)的5个南京椴(Tilia miqueliana Maxim.)居群的遗传多样性进行了分析,并采用UPGMA聚类方法研究了5个居群的遗传关系。结果表明:使用10条多态性引物从5个居群的总DNA中扩增出169条带,其中多态性条带151条,多态性条带百分率达89.34%。各居群的多态性条带百分率(PPB)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样度(h)和Shannon’s多样性指数(I)均有明显差异,其中,宝华山居群的各项指标均最高,紫金山和牛首山居群的PPB值最低,琅琊山居群的Ne值最低,紫金山居群的h和I值均最低。5个居群的I、h和Ne值分别为0.243 0~0.335 1、0.154 4~0.2182和1.248 9~1.362 7;在种水平上的I、h和Ne值分别为0.359 4、0.223 6和1.352 9。居群内变异占总变异的75.95%,居群间变异占总变异的24.05%。居群内和居群间的基因多样度分别为0.218 5和0.173 2,物种水平上的基因分化系数为0.207 5,居群间的基因流为1.909 3。各居群间的遗传距离差异较大;其中,皇藏峪与牛首山居群的遗传距离最近,仅为0.026 5;宝华山与紫金山居群的遗传距离最远,为0.134 4。通过聚类分析可将5个南京椴居群分为3支,宝华山和琅琊山居群各自独立为2支,皇藏峪、紫金山和牛首山居群聚为1支,且可进一步分为2个亚支,皇藏峪居群为1个亚支、紫金山和牛首山居群聚为1个亚支。研究结果表明:南京椴居群内的遗传多样性较高,但居群内的变异占主导地位,居群间存在明显的遗传分化。