小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析

编号 zgly0001714440

文献类型 期刊论文

文献题名 小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析

作者 柯希望  张金鹏  刘国辉  殷丽华  张盼盼  曹鸣宇  康静  杨阳  徐晓丹  郭永霞  左豫虎 

作者单位 黑龙江八一农垦大学国家杂粮工程技术研究中心黑龙江省作物有害生物互作生物学及生态防控重点实验室  黑龙江省土肥管理站  榆林学院生命科学学院 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S435.21 

关键词 小豆  小豆锈病  豇豆单胞锈菌  转录因子 

文摘内容       为明确小豆VaAP2/ERF家族基因在小豆应答豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)侵染中的作用,本研究采用生物信息学方法从小豆基因组中鉴定VaAP2/ERFs家族基因186个,包括AP2(24个)、RAV(2个)、Soloist(1个)及ERF(159个)四个亚家族,其中ERF亚家族又可分为DREB和ERF两个亚类。基因结构分析发现,68.3%的VaAP2/ERFs基因不具内含子。保守基序分析发现,各亚族成员保守域组成类似,可作为基因家族分类的重要依据。前期转录组测序发现VaAP2/ERF中的6个成员接种后24 h显著上调,进一步应用qPCR技术对其在‘1-D-3’(免疫)及‘宝清红’(感病)中应答锈菌侵染的表达分析发现,免疫品种中6个成员均于接种后6 h及120 h显著上调,另有2个于接种后12 h也显著上调,表明上述基因均在小豆抗锈病中发挥正调控作用。