希金斯炭疽菌磷酸二酯酶生物信息学分析

编号 zgly0000868236

文献类型 期刊论文

文献题名 希金斯炭疽菌磷酸二酯酶生物信息学分析

作者 韩长志 

作者单位 西南林业大学林学院  云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 科学技术与工程 

年卷期 2014(27)

页码 163-167

年份 2014 

关键词 希金斯炭疽菌  磷酸二酯酶  理化性质  亚细胞定位  二级结构 

文摘内容 磷酸二酯酶(Pde)在植物病原菌G蛋白信号传导途径上发挥着重要作用。Pde已在粟酒裂殖酵母菌、稻瘟病菌等中有相关报道,然而,对于侵染十字花科植物的希金斯炭疽菌中Pde研究尚不深入。基于酿酒酵母中已经报道的典型Pde序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,并通过SMART保守结构域分析。同时,通过对该菌中典型Pde氨基酸序列进行理化性质、疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,此外,通过对希金斯炭疽菌中的典型Pde与其他物种中的同源序列进行遗传关系比较分析。