基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析

编号 zgly0001634803

文献类型 期刊论文

文献题名 基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析

作者 王彦芹  沈李丽  罗来鑫  李健强  李志军 

作者单位 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室  塔里木大学生命科学学院  中国农业大学种子病理实验室 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 Q943.2 

关键词 沙漠植物  花花柴  干旱胁迫  mRNA-Seq  耐旱相关基因 

文摘内容 以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的m RNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达的基因54个,根部在不同处理时间均上调表达的基因73个,下调表达的基因79个。利用q RT-PCR和RT-PCR对可能与花花柴耐旱相关的6个差异表达基因进行了验证,发现其表达模式与表达谱结果一致,推测这些基因可能均与花花柴响应干旱胁迫相关。本研究为耐旱相关基因的发掘及应用提供了基础。