重庆市萝卜芜菁花叶病毒的检测与序列分析

编号 zgly0001639076

文献类型 期刊论文

文献题名 重庆市萝卜芜菁花叶病毒的检测与序列分析

作者 熊艳  孙淼  向华丰  王鹤冰  张洪成  青玲 

作者单位 重庆市农业科学院蔬菜花卉所  西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S436.31 

关键词 重庆市  萝卜  TuMV  CP基因  系统进化分析 

文摘内容 为明确重庆市萝卜感染芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)的情况,在重庆市巴南区、九龙坡区、北碚区等14个区县共采集了146份萝卜病毒病样品,采用酶联免疫吸附试验法(enzymelinked immunosorbent assay,ELISA)对病样进行TuMV检测,并通过PCR、克隆和测序等技术获得13个TuMV分离物CP核苷酸序列,利用软件分析重庆市TuMV CP基因序列的相似性,利用系统进化树分析CP基因遗传变异与系统进化。结果表明,共有105份样品的TuMV检测为阳性,检出率为71.9%;所得13个分离物CP基因均为864 bp,测序的13个分离物CP核苷酸相似性为89.1%~99.2%,与国内已报道的TuMV各分离物CP核苷酸相似性在88.3%~99.4%之间;所得的13个分离物均分布在basal-BR和world-B组中,在Asian-BR和basal-B组中均无分布,进一步分析发现有9个分离物属于word-B组,仅4个分离物属于basal-BR组。研究表明,TuMV在重庆市萝卜各种植区普遍发生,且word-B组为重庆市萝卜的优势毒源。