红壤荒草地氨氧化细菌富集液16S rDNA文库的RFLP分析

编号 zgly0000471459

文献类型 期刊论文

文献题名 红壤荒草地氨氧化细菌富集液16S rDNA文库的RFLP分析

学科分类 220.1040;森林土壤学

作者 张丽娜  曹慧  崔中利  孙波  李大力  李顺鹏 

作者单位 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室  中国科学院南京土壤研究所  南京理工大学化工学院 

母体文献 土壤学报 

年卷期 2006,43(4)

页码 635-641

年份 2006 

分类号 S154.34  Q938.1 

关键词 氨氧化细菌  16S  rDNA基因文库  富集液  RFLP  红壤 

文摘内容 分析红壤荒草地富集液中氨氧化细菌的种群组成, 选取氨氧化细菌16S rDNA特异性引物序列, 利用PCR技术对从富集液中抽提的细菌总DNA进行扩增, 并建立了氨氧化细菌特异性的16S rDNA文库。用酶HhaⅠ和RsaⅠ对该文库特异性片段进行了限制性酶切片断长度多态性分析(Restriction fragment lensth polymorphism, RFLP), 随机挑选的35个特异性克隆片段被分成3个不同的RFLP类型, 其中优势型占了所有分析克隆子的94%, 另两个型各占3%。从每个RFLP类型中挑取一定的转化子进行测序, 测序结果经GenBank检索, 发现在该富集液体系文库中存在大量亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)细菌序列, 由此推测红壤荒草地中存在氨氧化细菌, Nitrosomonas属细菌能在富集条件下成为优势菌。