不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析

编号 zgly0001579403

文献类型 期刊论文

文献题名 不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析

作者 赵芹  谢大森  彭庆务  罗少波  郭巨先  邓沙沙 

作者单位 广东省农业科学院蔬菜研究所 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2014年03期

年份 2014 

分类号 S642.9 

关键词 瓠瓜  ITS序列  变异位点  同源性  遗传分化  系统发育 

文摘内容 对国产29个瓠瓜〔Lagenaria siceraria(Molina)Standl.〕品种的ITS序列进行了扩增及测序,并结合引自GenBank的国产9个瓠瓜品种以及国外6个瓠瓜品种和3个同属种类的ITS序列,对它们的ITS序列长度和GC含量以及变异位点进行比较,在此基础上构建系统发育树并对47个样本间的遗传关系进行研究。结果显示:供试47个样本的ITS序列均由ITS1、5.8S rDNA及ITS2组成,各样本间的ITS序列长度、GC含量以及变异位点差异明显。国产38个瓠瓜品种的ITS序列(包括ITS1、5.8S rDNA及ITS2)长度为619~627 bp、GC含量为58.00%~63.32%;国外9个样本的ITS序列长度为591~626 bp,GC含量为54.17%~63.26%。序列比对结果显示:国产38个瓠瓜品种的ITS序列同源率为84.6%~100.0%,包含221个变异位点;其中,来源于山东的品种‘砧木2’(‘Zhenmu No.2’)的ITS序列包含的变异位点最多,与其他品种间的同源率也最低。在系统发育树上,国产38个瓠瓜品种可分为3个分支,来源于山东的品种‘砧木2’和来源于河南的品种‘西瓜砧木1’(‘Xiguazhenmu No.1’)各自聚为第1和第2分支;其余36个品种聚为第3分支。而供试的47个样本则可分为2个分支和5个亚组,第1分支可分为2个亚组,包括国产品种‘砧木2’和产自日本的2个品种;第2分支包含的44个样本则进一步分为3个亚组,国产品种‘西瓜砧木1’和产自法国的品种‘白花瓠瓜’(‘White-flowered gourd’)各自聚为第1和第2亚组,其余的42个样本聚为第3亚组。研究结果表明:供试的不同产地瓠瓜品种间存在丰富的遗传变异和地理分化现象,其ITS序列差异与地理分布有一定关系。