基于2b-RAD技术的家蚕BmNPV抗性关联基因的全基因组筛查

编号 zgly0001563541

文献类型 期刊论文

文献题名 基于2b-RAD技术的家蚕BmNPV抗性关联基因的全基因组筛查

作者 张正斌  张业顺  方瑷  何小柏  徐安英  吴阳春  张国政 

作者单位 江苏科技大学生物技术学院  中国农业科学院蚕业研究所农业部蚕桑遗传改良重点实验室 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 S881.2 

关键词 家蚕  家蚕核型多角体病毒  抗性遗传  基因型组成  2b-RAD技术 

文摘内容 不同家蚕品种对家蚕核型多角体病毒(Bm NPV)的抵抗性存在较大差异,家蚕抗性品系AN、野BN对Bm NPV侵染具有较强的抵抗性。用易感家蚕品系C108分别与AN和野BN杂交、回交,构建两个抗性品系的BC3M和BC4M分离群体,利用简化基因组测序技术2b-RAD(基于IIB型限制性内切酶的RAD)进行亲本和杂交分离群体的基因组测序,通过生物信息学方法筛选位于染色体上与抗性相关的多态性SNP标记,进行抗性品种的基因型分析。对3个亲本及2个抗性分离群体样本基因组DNA构建的2b-RAD标签文库进行Illumina测序,获得抗性亲本AN、野BN的多态性SNP标记11 919个和12 293个。对抗性分离群体全基因组染色体的Bm NPV抗性关联SNP标记指数(SNP-index)进行分析,结果表明亲本品系AN、野BN的Bm NPV抗性相关SNP标记分布在多个染色体上,其中AN的全基因组中抗性贡献率前5位是第5、10、27、23和4号染色体,野BN的全基因组中抗性贡献率前5位的是第4、27、15、18和6号染色体,有多个SNP-index高值位点与已知Bm NPV抗性相关基因的位置具有较高的一致性。推测AN、野BN两个品系的Bm NPV高抗性与抗性主基因和其他抗性基因的联合作用有关。