西番莲DNA条形码遗传多样性分析

编号 zgly0001545374

文献类型 期刊论文

文献题名 西番莲DNA条形码遗传多样性分析

作者 叶婵娟  马泽铭  周玲艳  刘文  柯辉鹏  梁红 

作者单位 仲恺农业工程学院生命科学学院  广州云震生物科技有限公司 

母体文献 中国南方果树 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S667.9 

关键词 DNA条形码  西番莲  遗传多样性  聚类分析 

文摘内容 对4个国家(地区)的13份西番莲种质用ITS、trnL-F、trnH-psbA等3种DNA条形码进行遗传多样性分析。结果表明,trnH-psbA条形码扩增出来的DNA序列的GC含量最低(27%),ITS条形码的DNA序列GC含量最高(63%);而trnL-F条形码扩增的DNA序列GC含量在不同种质间差异最大,在52.6%~62.3%之间。将3种DNA条形码序列在GeneBank中进行Blast比对,ITS和trnL-F序列基本与已登录种序列一致,达到77%以上,而trnH-psbA条形码序列与已登录种不一致。ITS条形码在序列间基因进化多样性分析显示,两两序列之间都具有差异;trnLF条形码序列的两两比较发现T1,T10,T11,T12,T13条形码序列之间无差异;trnH-psbA条形码序列的两两比较分析的差异最小,而H4与其他的序列差异较大,在13.3以上。从系统进化树来看,trnH-psbA条形码序列除了H4之外,其他样品聚为一类;trnL-F条形码序列中有5个不存在遗传差异;ITS条形码序列聚类的结果显示,每种西番莲均存在一定的遗传距离,这与基因多样化分析的结果一致。表明ITS在不同种质之间具有较高的多样性,可考虑应用于种质鉴定。