抗生素抗性基因连锁传播的侧翼保守元件分析

编号 zgly0000808029

文献类型 期刊论文

文献题名 抗生素抗性基因连锁传播的侧翼保守元件分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘建  毛大庆  任君  罗义  曹文清 

作者单位 沈阳药科大学生命科学与生物制药学院 

母体文献 应用生态学报 

年卷期 2012(1)

页码 240-246

年份 2012 

分类号 X171 

关键词 抗性基因  实时荧光定量PCR  Tail-PCR  tetW侧翼序列 

文摘内容 抗生素在医疗、畜牧和水产养殖业的大量使用造成了环境中耐药细菌和抗性基因的日益增加,也加速了抗性基因在环境细菌间的传播扩散.本研究以环境样本直接提取的总DNA为模板,运用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,Tail-PCR)技术直接扩增抗生素抗性基因上下游序列.通过优化Tail-PCR反应程序,单循环同时扩增出tetW基因的多条侧翼序列,包括6条上游序列和9条下游序列.基于序列的生物信息学分析发现,上游包括一段反向重复序列和已知的一段tetW调节肽序列以及一个已知的插入序列,下游包括一个保守的未知序列和一个开放式阅读框架(the open reading frame,ORF)编码甲基转移酶.结果不仅发现了可能协助tetW基因传播的功能元件,也提供了一个未知侧翼序列高效和便捷的研究方法,即采用Tail-PCR技术,一组样品即能便捷获得多条侧翼序列.