羊口疮病毒凤翔株ORFV121和vIL-10基因的生物信息学分析

编号 zgly0001469627

文献类型 期刊论文

文献题名 羊口疮病毒凤翔株ORFV121和vIL-10基因的生物信息学分析

作者 刘方  赵玄多  安贝  刘慧  高洋  张立强  贾芸晓  陈德坤 

作者单位 西北农林科技大学动物医学院 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2014年07期

年份 2014 

分类号 S852.654 

关键词 羊口疮病毒凤翔株  ORFV121  vIL-10  基因差异 

文摘内容 为分析羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因在凤翔(FX0910)强毒株(vORFV)和弱毒株(lvORFV)之间的差异,应用PCR方法扩增羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因的全长序列并测序,应用生物信息学软件分析基因的核酸、氨基酸相似性,蛋白的亲水性、二级结构以及抗原性。结果显示,lvORFV的ORFV121基因118位的谷氨酸缺失,说明该处发生的碱基突变为有意突变,该突变导致弱毒株相应蛋白的亲水性、二级结构发生变化,蛋白的抗原性在很多区域发生本质改变;vIL-10在蛋白质水平出现了5个氨基酸位点突变(14:V→W,49:A→P,57:T→M,72:R→C,102:I→V)和79位插入1个色氨酸。这些位点差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生了变化。ORFV121基因和vIL-10基因在vORFV和lvORFV之间存在差异,这些基因差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生改变。