家蚕油蚕oc突变体突变基因的精细定位

编号 zgly0001644159

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕油蚕oc突变体突变基因的精细定位

作者 殷娅茹  胡建  胡文波  杨成飞  王坤  刘春  林英  朱勇  王凌燕 

作者单位 西南大学生物技术学院家蚕基因组生物学国家重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 S881.2 

关键词 家蚕  油蚕突变体  尿酸  oc突变体  精细定位 

文摘内容 【目的】油蚕oc突变体是家蚕Bombyx mori油蚕突变体的一种,经典遗传学连锁图谱已经将oc突变基因定位在5号染色体40.8 c M座位。本研究旨在对oc突变体候选基因进行精细定位并克隆,探究oc性状形成的分子机制。【方法】以油蚕oc突变品系和野生型家蚕品系大造（Dz）为亲本,其杂交产生的F1代雄性个体与oc突变的雌性个体进行回交得到的1 397头BC1代个体为定位材料,以家蚕已经报道的基因组序列为参考设计markers,通过亲本及F1代个体筛选多态性markers,并利用多态性markers和BC1代个体对oc突变基因进行精细定位。通过半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR（q PCR）筛选oc紧密连锁区间内的候选基因,确定目标候选基因,继而克隆和测序该基因,分析油蚕oc突变的原因。【结果】利用1 397头BC1代个体和11对有效的多态性markers将oc突变基因定位在M10与M11两个markers之间,物理图谱距离大约为234 kb。通过家蚕基因组数据库对oc连锁区域内的基因进行检索发现该区域有5个预测基因。对这5个预测基因在10个家蚕品系中进行的表达分析发现,只有BGIBMGA003572基因在oc突变个体体壁的表达量明显比正常个体中的低。通过基因的同源分析发现该基因编码的蛋白和人类单羧酸转运蛋白9（可能的尿酸转运蛋白）是同源蛋白,推测其为oc突变的候选基因。对BGIBMGA003572进行的克隆和测序结果显示其编码序列有5个氨基酸在oc突变体中发生了突变。【结论】通过定位克隆,本研究将oc突变基因定位在了234 kb的紧密连锁区间,其中编码单羧酸转运蛋白9的BGIBMGA003572可能和oc突变体的表型有关。