Illumina MiSeq高通量测序分析不同品种桑树内生细菌多样性

编号 zgly0001655579

文献类型 期刊论文

文献题名 Illumina MiSeq高通量测序分析不同品种桑树内生细菌多样性

作者 吴燕燕  徐伟芳  罗琴  王玲莉  刘祎杨  陈凯  谢洁 

作者单位 西南大学生物技术学院 

母体文献 蚕学通讯 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 Q93 

关键词 IlluminaMiSeq高通量测序  桑树  内生细菌  多样性 

文摘内容 为了分析不同抗病性桑树品种内生细菌多样性,利用基于Illumina MiSeq的高通量测序技术,从桑椹菌核病不同抗性品种(抗性品种:长果桑与川桑7637;易感品种:新伦教与红果2号)中共获得有效序列92282条,将高于97%相似度的划分为一个操作分类单元(OTU),优化后得到5858个OTUs。内生细菌种群分析结果表明,变形菌门(Proteobacteria,36.10%)、厚壁菌门(Firmicutes,14.51%)、酸杆菌门(Acidobacteria,13.38%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,11.85%)以及放线菌门(Actinobacteria,6.35%)为各品种果桑的共有优势菌门,假单胞菌属(Pseudomonas,8.01%)为其共有优势菌属,但这些优势菌群在不同品种桑树中所占的比例均有差异。内生细菌多样性分析结果表明,抗性品种川桑7637的内生细菌多样性最高,长果桑次之,而易感品种新伦教与红果2号则相对较低。研究结果显示,桑树茎内具有丰富的内生细菌资源,抗性品种的内生细菌多样性高于易感品种。