现代月季Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

编号 zgly0001478464

文献类型 期刊论文

文献题名 现代月季Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

作者 李文天  杨涛  张晓莹  陈帅  李洲  车代弟 

作者单位 东北农业大学园艺学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2014年06期

年份 2014 

分类号 S685.12 

关键词 现代月季  Ty1-copia类逆转录转座子  逆转录酶  异质性 

文摘内容 本研究以8个现代月季品种为试验材料,根据Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从现代月季基因组中扩增出260 bp左右的目标条带。将扩增产物纯化后克隆于p MD18-T质粒载体,选择阳性克隆,再经菌落PCR鉴定、测序及序列分析,获得19条来源于现代月季的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列。研究发现这些序列的核苷酸长度集中于258~268 bp,存在较高的异质性,同源性范围3.4%~81.6%,主要表现在缺失突变,通过核苷酸聚类分析分为四类家族。翻译成氨基酸后,发现存在移框突变和终止密码子突变的现象,将这19条来源于现代月季的逆转录酶序列与登录在NCBI上来自于其它植物的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的氨基酸序列聚类分析,结果表明现代月季与其它物种间具有较高的同源性,表明Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列在不同物种之间可能存在横向传递。