金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

编号 zgly0001513942

文献类型 期刊论文

文献题名 金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

作者 金群力  沈颖越  蔡为明  周烁红  范丽军  冯伟林  宋婷婷  李良英  田芳芳 

作者单位 浙江省农业科学院园艺研究所  浙江师范大学化学与生命科学学院 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S646.15 

关键词 金针菇基因组  SSR位点  多态性标记 

文摘内容 以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%。设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%。