结球甘蓝花粉蛋白延伸因子基因的克隆及其序列分析

编号 zgly0001456933

文献类型 期刊论文

文献题名 结球甘蓝花粉蛋白延伸因子基因的克隆及其序列分析

作者 王志敏  牛义  许俊强  孙梓健  丁泽琴  杨修勤  汤青林  宋明 

作者单位 西南大学园艺园林学院  南方山地园艺学教育部重点实验室  重庆市蔬菜学重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年10期

年份 2013 

分类号 S635.1 

关键词 结球甘蓝  花粉  延伸因子 

文摘内容 以结球甘蓝(Brassica oleracea L.var.capitata L.)E1花粉为试材,对萌发前后的花粉总蛋白进行双向电泳及差异蛋白质谱分析,发现延伸因子BoEF-Tu蛋白在花粉萌发后较萌发前表达上调。利用同源克隆得到甘蓝BoEF-Tu基因的全长cDNA序列,其长度为1 728 bp,具有一个完整开放阅读框(ORF),位于112～1 473 bp处,编码453个氨基酸残基,预测分子量为49.17 kD,等电点为6.52。生物信息学分析表明:BoEF-Tu蛋白含有9个α–螺旋结构,18个β–折叠结构,不含信号肽和跨膜区,在106～121位氨基酸残基处有1个GTP结合区域(DKAPEEKKRGITIATA)。氨基酸同源性分析表明,BoEF-Tu与拟南芥EF-TuM同源性较高,达到93%;系统进化分析表明,BoEF-Tu与拟南芥EF-Tu的亲缘关系最近。