桃EXPANSIN基因家族序列特征及其在根结线虫侵染后的诱导表达分析

编号 zgly0001571683

文献类型 期刊论文

文献题名 桃EXPANSIN基因家族序列特征及其在根结线虫侵染后的诱导表达分析

作者 张倩  曹珂  朱更瑞  方伟超  王新卫  王力荣 

作者单位 中国农业科学院郑州果树研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 S436.621 

关键词 桃  EXPANSIN基因家族  南方根结线虫  抗性 

文摘内容 【目的】探索扩张蛋白（EXPANSIN）基因家族在桃抗南方根结线虫过程中的作用。【方法】首先对桃基因组中的EXPANSIN基因家族进行生物信息学分析,然后利用转录组测序对EXPANSIN基因在南方根结线虫侵染免疫型（‘红根甘肃桃1号’）和高感型（‘贝蕾’）桃种质根系后的不同时期的表达丰度进行分析。【结果】桃EXPANSIN基因家族有27个成员,这些成员分布在8条染色体上,以第2和第5号染色体上最多,均为5个。基因结构分析显示,这些基因包含15个外显子,大部分EXPANSIN基因包含DPBB1和Pollenallerg1保守结构域,聚类分析将这27个成员分为2大类,其中有8个与拟南芥中已注释的与线虫侵染过程中巨细胞形成有关的蛋白质聚在一起,均属于EXPA亚类。转录组分析表明,这8个EXPANSIN基因在对南方根结线虫免疫和高感2种种质不同时期的表达趋势存在明显差异,其中ppa010314m、ppa010226m在‘贝蕾’中表达量随侵染上调,而在‘红根甘肃桃1号’中上调不明显,这2个基因可能是参与南方根结线虫侵染过程中巨细胞形成的关键基因。【结论】桃EXPANSIN家族成员在结构上高度保守,其中多个成员可能参与调控桃抗南方根结线虫过程。