基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究

编号 zgly0001633678

文献类型 期刊论文

文献题名 基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究

作者 毛迎新  谭荣荣  王友平  陈勋  王红娟  黄丹娟  龚自明 

作者单位 湖北省农业科学院果树茶叶研究所  湖北省农业科学院植保土肥研究所农业部华中作物有害生物综合治理重点实验室 

母体文献 植物保护 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S435.711 

关键词 小贯小绿叶蝉  细菌  16SrDNA  多样性 

文摘内容 利用Illumina HiSeq技术,对赤壁、大悟、武汉、咸安和英山5个茶园小贯小绿叶蝉地理种群的成虫共生细菌16SrDNA-V4变异区进行测序,应用Uparse和RDP Classifier等软件统计和分析样本的物种组成、丰度和多样性。5个地区小贯小绿叶蝉成虫的16SrDNA基因序列文库共获得239 645条有效tags,在97%相似阈值下将其聚类为3 403个OTUs。共注释到41个门,116个纲,197个目,272个科,372个属,105个种。5个样本的共生菌在不同分类水平上的组成有所不同,其中在门水平上,主要优势菌为变形菌门Proteobacteria(相对丰度60.6%~97.1%);在纲水平上,相对丰度排名前5位中共有的优势菌为γ-变形菌纲Gammaproteobacteria和α-变形菌纲Alphaproteobacteria;在属水平上,排名前10位中5个样本共有的优势菌为盐单胞菌属Halomonas、希瓦氏菌属Shewanella和沃尔巴克氏体属Wolbachia。小贯小绿叶蝉成虫细菌的Chao指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数分别为1 065.55~2 841.89,1 130.76~2 914.90,1.07~8.63和0.18~0.99。茶园小贯小绿叶蝉成虫共生细菌多样性比较丰富,不同地理种群的小贯小绿叶蝉细菌群落结构和多样性有差异。本研究结果为进一步研究细菌对小贯小绿叶蝉种群生物学的影响奠定了基础。