Rhodopseudomena viridis细菌光合作用反应中心质体醌Q_A 与泛醌Q_B 间电子转移耦合质子转移机理的理论研究(英文)

编号 zgly0001257446

文献类型 期刊论文

文献题名 Rhodopseudomena viridis细菌光合作用反应中心质体醌Q_A 与泛醌Q_B 间电子转移耦合质子转移机理的理论研究(英文)

作者 马淑华  徐红  张汝波  屈正旺  张兴康  张启元 

作者单位 中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态与稳态结构国家重点实验室  中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态与稳态结构国家重点实验室 北京100080  北京100080  北京100080 

母体文献 Acta Botanica Sinica 

年卷期 2002年12期

年份 2002 

分类号 Q935 

关键词 Rhodopseudomenaviridis  电子转移  质子转移  QA和QB  DFT 

文摘内容 用量子化学B3LYP/ 6 - 31G(d)方法 ,对Rhodopseudomenaviridis细菌光合反应中心质体醌QA(MQ1)与泛醌QB(UQ1)间的电子转移耦合质子转移 (PT_ET)机理进行了研究。对反应 (1)之后的Gibbs自由能变化进行了计算。结果表明 ,(1)按照各反应的数值 ,在无耦合质子转移的情况下 ,UQ1不可能由MQ-1连续接受两个电子。由于ΔG02b 0 ,ΔG03b 0和ΔG04b 0 ,相应的PT ET反应将依序沿 (2b)、(3b)及 (4b)进行。 (2 )在气相情况下 ,由于周围的氨基酸残基或水分子转移到UQ1的第一个及第二个质子 (H+ (1)和H+ (2 ) )将先后分别与UQ1的No.7和No .8氧原子结合 ;在蛋白环境情况下 (SCRF方法 ,ε =4 .0 ) ,质子耦合的顺序正相反 ,但H+ (1)和H+ (2 )与UQ-1结合的能量传递差很小。在气相及SCRF模拟环境中 ,相同反应间的ΔG0 无显著差别。 (3)MQ-1间UQ-1的PT ET反应如下 :　　MQ1-+UQ1→MQ1+UQ1-(1)　　UQ1-(O( 7) ) +H+ (HisL190 )→UQ1H (2b) (Gas)or　UQ1-(O( 8) ) +H+ (H2 O)→UQ1H (2b’) (SCRF)or　UQ1-(O( 8) ) +H+ (ArgL2 17)→UQ1H (2b’) (SCRF)　　MQ1-+UQ1H→MQ1+UQ1H-(3b) (Gas)　　MQ1-+UQ1H→MQ1+UQ1H-(3b’) (SCRF)　　UQ1H-+H+ (H2 O)→UQ1H2 (4b) (Gas)or　UQ1H-+H+ (ArgL2 17)→UQ1H2 (4b) (Gas)or　UQ1H-+H+ (Hi