基于线粒体DNA部分片段探讨石鲽与星突江鲽的亲缘关系

编号 zgly0000703366

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体DNA部分片段探讨石鲽与星突江鲽的亲缘关系

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 肖永双  张岩  高天翔 

作者单位 中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室  中国水产科学研究院黄海水产研究所 

母体文献 中国海洋大学学报: 自然科学版 

年卷期 2010(6)

页码 69-76

年份 2010 

分类号 Q959.4 

关键词 石鲽  江鲽  线粒体DNA遗传距离  分歧时问 

文摘内容 比较分析了石鲽和星突江鲽线粒体基因组COI、Cytb基因以及D-loop片段总长度为1175 bp的核苷酸序列,探讨了石鲽与星突江鲽的亲缘关系。2种间共检测到95处核苷酸替代,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是第三密码子位点上的同义替换。核苷酸组成分析结果表明: 3个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在2个蛋白质编码基因第三密码子位点上表现得尤为明显。线粒体COI、Cytb基因和D-loop片段序列分析显示石鲽与星突江鲽间平均遗传距离分别为0.043、0.062和0.153,属于属内种间差异水平。2种鲽鱼在线粒体基因组不同片段上存在明显的遗传分化,核苷酸替代速率由大到小依次为D-loopCytbCOI。贝叶斯法、邻近距离法和最大简约法构建的系统发育树一致,皆显示石鲽与星突江鲽遗传关系很近。基于Cytb基因片段序列的分析结果表明: 石鲽与星突江鲽的分歧时间约为185万年,分化事件发生于更新世中期(Middle Pleistocene)。