生命之树及其应用

编号 zgly0001630480

文献类型 期刊论文

文献题名 生命之树及其应用

作者 鲁丽敏  孙苗  张景博  李洪雷  林立  杨拓  陈闽  陈之端 

作者单位 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室  中国科学院大学 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2014年01期

年份 2014 

分类号 Q111 

关键词 生命之树  系统发育  基因树冲突  生物地理  生物多样性  系统发育多样性 

文摘内容 生命之树的概念由达尔文在1859年提出,用以反映分类群的亲缘关系和进化历史。近30年来,随着建树性状种类的多样化、数据量的快速增长以及建树方法的不断发展和完善,生命之树的规模越来越大,可信度也越来越高。分子生物学、生态学、基因组学、生物信息学及计算机科学等的快速发展,使得生命之树成为开展学科间交叉研究的桥梁,其用途日益广泛。本文综述了生命之树研究的历史和现状,介绍了生命之树在以下几个方面的应用:(1)通过构建不同尺度的生命之树,理解生物类群间的系统发育关系;(2)通过时间估算和地理分布区重建,推测现存生物的起源和地理分布格局及其成因;(3)基于时间树,结合生态、环境因子及关键创新性状,探讨生物的多样化进程和成因;(4)揭示生物多样性的来源和格局,预测生物多样性动态变化,并提出相应的保护策略。最后,本文评估了生命之树在目前海量数据情况下遇到的序列比对困难、基因树冲突、流浪类群干扰等建树难题,并指出了构建超大树的发展趋势。